סופי וג´וש, תאומים בני 15, לא ידעו שהם בעצם קוסמים בעלי כוחות מיוחדים. את יכולות הכישוף שלהם הם מגלים לגמרי במקרה, כשחנות הספרים שבה עובד ג´וש בחופש הגדול נשדדת, והשודדים גונבים ממנה ספר נדיר וחוטפים את אחד מבעלי החנות.
התקרית הזאת משנה את חיי התאומים לנצח. הם מגלים שהספר הגנוב הוא אוסף עתיק ונדיר של כשפים, ובעלי החנות, ניק פרי, הוא בעצם ניקולס פלמל, אלכימאי בן המאה ה-14 שמסוגל להפוך מתכות פשוטות לזהב ולרקוח שיקוי לחיי נצח.
ככה נקלעים סופי וג´וש אל מאבק סוער בין כוחות האופל המנסים להחריב את העולם לבין קבוצה של פיות, אלות, קוסמים ושדונים המגייסים את כל כוחותיהם כדי להציל אותו. הם פוגשים יצורים מוזרים ומתוודעים למיתוסים ואגדות מתרבויות שונות, וכל אלה משולבים בעלילה מהפנטת ומענגת, מפחידה ובעיקר סוחפת מאוד.
האלכימאי הוא ספר ראשון בסדרת הסודות של ניקולס פלמל בן האלמוות, שכבשה את דמיונם של בני נוער ברחבי תבל.
מייקל סקוט, אחד מסופריה הפוריים של אירלנד, כתב כ-100 ספרים למבוגרים ולבני נוער, ספרי פנטזיה ומדע בדיוני, זכויות התרגום של הסודות של ניקולס פלמל בן האלמוות נקנו על ידי מו"לים ב-30 מדינות, וזכויות ההסרטה נקנו על ידי "ניו ליין סינמה", מפיקי "שר הטבעות".
