הוברמן שימש שנים רבות ככתב לענייני יש"ע בעיתון הצופה. בין ינואר 2009 למאי 2010 שימש הוברמן ככתב הצבאי של עיתון המבשר, שם הוא כתב תחת שם העט ח. בן אפרים. הוא פוטר בעקבות ביקורת קשה שמתח על חבר הכנסת יעקב ליצמן.

מאז 2009 משמש כעורך השבועון הדתי מצב הרוח ומשמש גם ככתב המדיני והצבאי בשבועון החרדי "בקהילה". ב-2010 זכה הוברמן בפרס עמינח לחקר תולדות ההתיישבות הציונית דתית, על ספריו "שורשים בחולות" ו"כנגד כל הסיכויים".