העיניים הירוקות שהביטו בו באימה מבעד לניקאב היו המראה האחרון שנחרת בזיכרונו של נמרוד לפני שעולמו חשך עליו. אותן עיניים שבות ופוקדות אותו במקומות ובזמנים בלתי צפויים, והחיפוש אחר זהותה של הצעירה המסתורית הופך אצלו לאובססיה שאיננה נותנת לו מנוח.
בעזרת דויטש, ידידו החרדי, יוצא נמרוד למסע בעקבותיה. ככל שהוא מתקרב אל האמת, הולך ונחשף קשר מפתיע בין הצעירה המסתורית לבין הישרדותו בתאונת אימונים, מזימת התנקשות בחייו של רבין והיעלמותה המסתורית של ילדה חרדית בת חמש.
עלילת המתח, הנרקמת על רקע האירועים המטלטלים שעיצבו את ישראל בשנות השמונים והתשעים, שוזרת בתוכה יחסי יהודים וערבים, חילונים וחרדים, ימין ושמאל. ככל שהאמת נחשפת, כך מתבהרת השפעתם של מנהיגים על עיצוב דמותה, אופייה וגורלה של אומה, ומתוך כך עולה השאלה – האם בראי ההיסטוריה רצח פוליטי יכול להיות מוצדק?
עיניים ירוקות הוא רומן מתח פוליטי־היסטורי סוחף המעלה שאלות מוסריות, משלב מסתורין, דרמה אנושית ואירועים היסטוריים, ומוביל את הקורא אל המפגש הטעון שבין גורל אישי לטלטלה לאומית.