זקוביץ הוא מיוזמי והוגי תוכנית "רביבים" להכשרת מורים להוראת מדעי היהדות.‏ הוא מרצה אורח באוניברסיטת פנסילבניה, אוניברסיטת קליפורניה בברקלי, בית המדרש לרבנים באמריקה ובאוניברסיטת הרווארד. מלמד במרכז הבינתחומי הרצליה במסגרת מרכז נבזלין לעמיות יהודית.